Ini adalah kisah dari seorang Niihama Shinchirou, yang pingsan setelah dibinasakan oleh sebuah organisasi hitam yang terbangun dan mendapati dirinya telah dikirim kembali ke masa kelas dua SMA-nya. Ketika terbangun, ia mendapati dirinya melompati waktu ke masa kelas dua SMA-nya. Kehidupan SMA-nya ….. kelabu dan teduh, tetapi ia yakin kalau ia dapat memulai dari awal…

Setelah ia lulus dari SMP, Nagito Senda mulai memacari Kiri Asatani, tetapi ia dicampakkan ketika mereka mulai masuk SMA. Setelah pulih dari patah hatinya, ia melihat Nozomi Takane, seorang gadis di kelasnya, sedang dilecehkan oleh seorang perekrut klub yang pemaksa, dan memutuskan untuk membantunya. Mereka berdua dengan cepat semakin dekat seperti mereka duduk bersama di…

Sang protagonis mulai terlibat dengan gadis tercantik di sekolah, yang terkenal dengan sikap dinginnya, dan perlahan-lahan menjadi tertarik padanya (gadis itu). Sang protagonis itu menemukan dirinya dalam hubungan konsultasi dengan seorang gadis biasa berkacamata di pekerjaan paruh waktunya. Ia tidak menyadari bahwa gadis yang ia konsultasikan adalah gadis yang sama dengan yang ia cintai, dan…